ภูมิคุ้มกันในระยะแรกของการติดเชื้อ

ประเมินการโต้ตอบของไวรัสโฮสต์และการตอบสนองของภูมิคุ้มกันในระยะแรกของการติดเชื้อระบบวิธีการแทนและตีความการโต้ตอบที่ซับซ้อนการวิเคราะห์ยีนที่ได้รับการอนุรักษ์ พวกเขายังทำการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศเพิ่มเติมประเภทอื่น ๆ ซึ่งรวมวิธีการและเครื่องมือจากวิทยาการคอมพิวเตอร์ชีววิทยาคณิตศาสตร์สถิติวิศวกรรมสารสนเทศและสาขาอื่น ๆ

เปรียบเทียบการตอบโต้ของเชื้อไวรัสและการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันต่อ SIV รวมถึงโพรไฟล์การแสดงออกของยีนจากลิงสีเขียวของแอฟริกาซึ่งเป็นโฮสต์ธรรมชาติของเอชไอวี ข้อมูลที่คล้ายกันจากการติดเชื้อ HIV ของมนุษย์ก็ถูกประเมินเช่นกันการใช้ชุดข้อมูลสาธารณะเป็นองค์ประกอบสำคัญของการวิจัยนี้และเน้นความสำคัญของชุมชนวิทยาศาสตร์ที่ใช้ข้อมูลร่วมกันในฟอรัมสาธารณะติดเชื้อเซลล์ภูมิคุ้มกันที่เรียกว่า T helper cells เซลล์เหล่านี้มีมากมายในลำไส้และในเนื้อเยื่อพิเศษที่อื่น ๆ ในร่างกาย การติดเชื้อเอชไอวีกระตุ้นให้เกิดการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่ทำร้ายเนื้อเยื่อรอบลำไส้ การบาดเจ็บนี้ช่วยให้แบคทีเรียที่อาศัยอยู่ในลำไส้โดยปกติจะแทรกซึมเนื้อเยื่อและบุกเว็บไซต์อื่น ๆ ในร่างกาย ทำให้เกิดการอักเสบและความเสียหายต่อไป